Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 SEC22A-210ENST00000492595 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 NPY6R-201ENST00000503807 1112 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC093821.1-201ENST00000503950 539 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 ZBED3-AS1-203ENST00000504506 702 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC091175.1-201ENST00000522168 572 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 HHLA3-207ENST00000531950 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 LINC02384-207ENST00000542875 551 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC079362.1-202ENST00000547089 278 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC034102.7-201ENST00000550840 470 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AL591767.1-201ENST00000557160 568 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 TRIM69-210ENST00000561043 1017 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 FLJ21408-204ENST00000566854 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 TTC39A-AS1-202ENST00000568425 554 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC026461.2-201ENST00000568608 244 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 DLGAP1-AS3-201ENST00000577649 1258 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 CDRT8-201ENST00000579752 467 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC093074.1-201ENST00000590280 556 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AF146191.1-201ENST00000604941 889 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AP002345.2-201ENST00000609961 904 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 HIST1H2BM-201ENST00000621112 381 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 C1orf137-201ENST00000624685 386 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 NR1I3-235ENST00000628566 1201 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 TNFRSF19-203ENST00000382263 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 RAD54B-202ENST00000336148 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 ATP5A1P10-201ENST00000622403 1603 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 ZNF121-201ENST00000320451 1563 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 DLC1-215ENST00000520226 3556 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 SERPINA6-201ENST00000341584 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC019117.1-201ENST00000636929 1462 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 MFSD8-243ENST00000641695 1455 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 TMC3-AS1-206ENST00000612811 2726 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 PSG1-203ENST00000403380 1722 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 DTNA-201ENST00000269192 1964 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 SEPT14-201ENST00000388975 3785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 ABCB5-205ENST00000443026 2247 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 PSEN1-201ENST00000324501 6078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 LDHB-201ENST00000350669 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 OR1C1-201ENST00000408896 1307 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 RND3-202ENST00000375734 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 ADA2-203ENST00000399837 4505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 G3BP2-203ENST00000395719 4217 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC023886.2-201ENST00000321285 411 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 OR4D9-201ENST00000329328 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 TRAV8-3-201ENST00000390435 341 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 PHBP1-201ENST00000392260 808 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 RPL24-201ENST00000394077 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 NPM1P46-201ENST00000399556 865 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 VN1R13P-201ENST00000406212 885 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AL451048.1-201ENST00000413328 217 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 PPIAP2-201ENST00000414143 492 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC011753.4-201ENST00000417974 311 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC003071.2-201ENST00000423857 315 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC009495.3-201ENST00000425688 779 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AL157400.1-201ENST00000428166 368 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 PYHIN5P-201ENST00000431627 723 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 RPS13P2-201ENST00000437890 455 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms