Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 IGHVIII-13-1-201ENST00000517613 291 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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RNF17Q9BXT8 CDH13-201ENST00000268613 2722 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 AF131215.2-201ENST00000531549 1710 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 NXF2B-202ENST00000602195 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 NXF2-202ENST00000625106 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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RNF17Q9BXT8 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 TMEM167A-201ENST00000502346 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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RNF17Q9BXT8 DMBT1-205ENST00000368955 7656 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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RNF17Q9BXT8 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 USP13-203ENST00000496897 2747 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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RNF17Q9BXT8 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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RNF17Q9BXT8 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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RNF17Q9BXT8 MEGF10-201ENST00000274473 7594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 HRH1-201ENST00000397056 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
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RNF17Q9BXT8 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 AC022182.1-202ENST00000529234 580 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
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