Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 RPS2P45-201ENST00000469997 2057 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 SPAG11B-201ENST00000297498 795 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 DEFB4A-201ENST00000302247 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 NPM1P14-201ENST00000343743 866 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 IGHV2-26-201ENST00000390611 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 NPPA-AS1-201ENST00000400892 936 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 TIMD4-203ENST00000407087 1145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 AC235097.1-201ENST00000412163 681 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 AL121823.1-201ENST00000418369 741 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 CFAP58-AS1-201ENST00000435434 795 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 AC009518.3-201ENST00000438972 253 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 GOT2P2-201ENST00000450663 1251 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 MEF2AP1-201ENST00000454867 863 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 RN7SL456P-201ENST00000469290 295 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 AC126615.1-201ENST00000470084 630 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 AC025271.1-201ENST00000485045 429 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 RN7SL518P-201ENST00000491887 280 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 RPL23AP80-201ENST00000495605 424 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 AC008906.1-201ENST00000512856 993 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 LINC01146-203ENST00000555996 459 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 FAM30C-201ENST00000561158 410 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 AC068254.1-201ENST00000584753 483 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 MIR6736-201ENST00000616799 59 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 AC022613.3-201ENST00000560740 1346 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 KYNUP2-201ENST00000582280 1329 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 AC097717.1-227ENST00000594069 1322 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 AL139039.3-201ENST00000413129 1475 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 PDCL3P5-201ENST00000398028 722 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 RN7SKP137-201ENST00000411074 307 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 AC106870.2-201ENST00000421411 691 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 KCND3-AS1-202ENST00000427471 583 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 AL022157.1-201ENST00000439622 665 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 EEF1A1P28-201ENST00000450915 1403 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 AL096803.1-201ENST00000456921 1021 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 RN7SL149P-201ENST00000465197 281 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 UCK2-206ENST00000470820 1083 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 RPS26P6-201ENST00000475156 348 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 PPP1R2P6-201ENST00000478565 588 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 HNRNPCP8-201ENST00000528764 888 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 AP002336.1-201ENST00000531426 422 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 QRSL1P3-201ENST00000552666 1316 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 AC008551.1-201ENST00000575612 405 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 AC006120.1-201ENST00000579375 546 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 AL365259.1-201ENST00000606334 509 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 ALKAL2-208ENST00000619265 496 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 LINC01141-204ENST00000635564 1008 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 MIR665-201ENST00000635949 72 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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