Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 NUSAP1-202ENST00000414849 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 PHYHIPL-202ENST00000373880 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 AC080011.1-201ENST00000552378 989 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 LINC02324-201ENST00000531609 1442 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 EPHA6-204ENST00000502694 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 CD300E-201ENST00000392619 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 CYB5B-201ENST00000307892 4286 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 CAST-236ENST00000511782 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 ENSA-204ENST00000356527 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 NOX1-204ENST00000372966 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 CNNM2-202ENST00000369878 15857 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 SPOCK1-201ENST00000282223 4488 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 CD46-208ENST00000367042 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 APOL3-203ENST00000397287 3626 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 RPL5P34-201ENST00000426545 891 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
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HOXD10P28358 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 FOXP1-AS1-201ENST00000465742 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
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HOXD10P28358 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 AC145138.1-201ENST00000512908 2851 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 CRYAB-207ENST00000527950 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
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HOXD10P28358 AC034111.1-201ENST00000562143 3770 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
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HOXD10P28358 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 POT1-AS1-204ENST00000449642 3238 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 FAM13A-AS1-202ENST00000511543 2453 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AC097478.1-207ENST00000612706 2422 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 FBXL4-202ENST00000369244 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 BRD8-201ENST00000230901 3198 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 LAMP2-202ENST00000371335 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 OR1C1-201ENST00000408896 1307 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 PART1-203ENST00000515734 2569 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 CCDC148-AS1-201ENST00000412781 795 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
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