Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 ZNF658-206ENST00000621410 4025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 MAPK10-244ENST00000639972 2818 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 MRPS18C-201ENST00000295491 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 RNF146-210ENST00000608991 2169 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 GNG12-201ENST00000370982 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 ADGRF2-201ENST00000296862 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AL450313.1-201ENST00000366376 452 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC073842.1-201ENST00000376482 342 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 SNORA14B-201ENST00000384452 135 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 SNORA73.3-201ENST00000410213 189 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC011747.1-201ENST00000425678 565 ntTSL 4 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 LINC01728-201ENST00000428529 524 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC105942.1-202ENST00000438509 952 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 RPL37A-204ENST00000441179 529 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC098828.2-201ENST00000452342 573 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 DISC1-IT1-201ENST00000456782 762 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 ANK3-213ENST00000486349 493 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC091982.1-201ENST00000518134 520 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC104211.2-201ENST00000521317 436 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AP000435.1-201ENST00000528539 496 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC007751.2-201ENST00000534173 291 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC079384.1-201ENST00000548506 600 ntTSL 4 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC103968.1-201ENST00000557841 573 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC116348.2-201ENST00000563751 577 ntTSL 4 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 LCMT1-AS1-202ENST00000563962 766 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC068014.1-201ENST00000576836 413 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC103808.6-201ENST00000578035 464 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 GOSR1-212ENST00000581721 756 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AP006587.6-201ENST00000582128 1091 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 CCDC162P-202ENST00000368966 6751 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 TMEM246-203ENST00000374851 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 TCL6-206ENST00000467865 3663 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 NOS2P3-202ENST00000458685 3328 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 GLYAT-202ENST00000344743 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 ZNF562-208ENST00000590155 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 MRPL22-201ENST00000265229 3035 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 PDIK1L-202ENST00000374271 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 GABPB2-201ENST00000368916 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 LINC02282-201ENST00000535153 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 Z99129.4-201ENST00000624649 2435 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 RALBP1-206ENST00000609094 3676 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 ZC3H11B-202ENST00000636126 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 PLCE1-AS2-202ENST00000432782 1612 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 MUM1L1-201ENST00000337685 4308 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 CDKL5-209ENST00000635828 3823 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 OPALIN-202ENST00000393870 3578 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 CDH18-201ENST00000274170 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 MYOCD-201ENST00000343344 2817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 WDR64-204ENST00000437684 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC002540.1-201ENST00000625023 1349 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 NAA11-201ENST00000286794 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 ZFP2-202ENST00000520301 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 ACTA2-AS1-201ENST00000437930 2450 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 IL26-201ENST00000229134 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP427-201ENST00000365323 119 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 MXI1-204ENST00000369612 879 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 MIR654-201ENST00000385199 81 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 IGKV3-15-201ENST00000390252 442 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AL590143.1-201ENST00000405071 138 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 PPIAP2-201ENST00000414143 492 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 CSE1L-AS1-201ENST00000417781 556 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms