Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ALG13-225ENST00000621367 3893 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 OR2T1-202ENST00000642005 2104 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC132219.2-201ENST00000624416 2327 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 SLC24A1-209ENST00000537259 3983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC010145.1-201ENST00000422415 516 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 PRDX1P1-201ENST00000449329 596 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 RPS2P45-201ENST00000469997 2057 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 FKBP14-201ENST00000222803 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ARHGEF9-225ENST00000636276 4097 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 OR4K17-202ENST00000641386 4886 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 KDM5D-210ENST00000541639 5579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 SPATA31D4-201ENST00000419782 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 EIF4G2-202ENST00000396525 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ARID1B-210ENST00000635849 5830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC096564.2-201ENST00000512428 3147 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 SLC13A3-202ENST00000290317 3994 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 KDM7A-201ENST00000397560 9272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 NLK-201ENST00000407008 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 HERC2P2-205ENST00000619021 5746 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AL024493.1-201ENST00000449217 833 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 NUCKS1P1-201ENST00000452067 703 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 CAGE1-203ENST00000379918 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 FUT10-206ENST00000518672 3115 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 CCDC62-203ENST00000392440 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 PHACTR2-201ENST00000305766 1851 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 TNIK-211ENST00000475336 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 CHRDL1-203ENST00000394797 2413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ATXN2-214ENST00000535949 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 PIGN-238ENST00000639758 4239 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 WIPF2-201ENST00000323571 7474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 RPL36P1-201ENST00000419720 225 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 PTPRB-201ENST00000261266 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ZNF557-202ENST00000414706 5736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 DCTN4-203ENST00000447998 4208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 SUPT6H-202ENST00000347486 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 SLC26A9-201ENST00000340781 4510 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 CLCN4-202ENST00000380833 6750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 DLG3-210ENST00000542398 4529 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 DPCR1-201ENST00000304311 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC002090.1-201ENST00000625000 2138 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 HERC3-201ENST00000264345 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LINC01706-201ENST00000455299 748 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC004943.1-203ENST00000624370 1074 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ARHGEF9-201ENST00000253401 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
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