Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 C2orf74-204ENST00000464909 726 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 LINC01098-201ENST00000507870 1034 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC011405.1-203ENST00000510110 1067 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AP000662.1-201ENST00000530952 487 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 NQO1-205ENST00000561500 891 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC126323.4-201ENST00000566935 234 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC024267.3-201ENST00000579673 562 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC005208.1-202ENST00000587325 725 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC103564.3-201ENST00000621194 220 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC106782.7-201ENST00000624024 418 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC133555.5-201ENST00000624430 418 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AL592430.1-202ENST00000414383 1546 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AL359694.2-201ENST00000567753 1615 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 OR52D1-201ENST00000322641 1065 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC007349.3-201ENST00000415356 872 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AL161742.1-201ENST00000418154 584 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AL162582.1-201ENST00000419196 467 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AL138479.1-201ENST00000426913 484 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC007179.2-206ENST00000434611 467 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC019186.1-201ENST00000447019 545 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 SCDP1-201ENST00000455244 1081 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 PGAP2-210ENST00000464441 699 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 RN7SL849P-201ENST00000485236 295 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 RN7SL868P-201ENST00000485915 303 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC026774.2-201ENST00000513990 1098 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 C8orf37-AS1-201ENST00000517437 456 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC156455.1-201ENST00000538790 851 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC010761.3-201ENST00000578819 499 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 RN7SL426P-201ENST00000579106 295 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 RPS27AP19-201ENST00000597285 458 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 FXYD6P1-201ENST00000604857 285 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AL353807.4-201ENST00000604995 257 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC009283.1-201ENST00000615852 645 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AL121985.3-201ENST00000620690 523 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 RALYL-204ENST00000518566 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC007012.2-201ENST00000623206 1676 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC096571.1-201ENST00000325407 306 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.1 ms