Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB5AP20339 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB5AP20339 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB5AP20339 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB5AP20339 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB5AP20339 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB5AP20339 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB5AP20339 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB5AP20339 IRAK4-202ENST00000440781 1409 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB5AP20339 PPP4R3CP-201ENST00000412172 3131 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB5AP20339 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB5AP20339 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB5AP20339 LIPF-202ENST00000355843 1357 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB5AP20339 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB5AP20339 AC087045.3-201ENST00000623046 2468 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB5AP20339 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB5AP20339 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB5AP20339 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB5AP20339 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB5AP20339 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB5AP20339 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB5AP20339 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB5AP20339 CLEC4A-202ENST00000345999 841 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB5AP20339 SGMS1-201ENST00000361543 1096 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB5AP20339 RNA5SP238-201ENST00000365464 120 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB5AP20339 GCG-201ENST00000375497 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB5AP20339 IGFL2-201ENST00000377693 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB5AP20339 NPM1P31-201ENST00000399021 764 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB5AP20339 SNRPD3-202ENST00000402849 567 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB5AP20339 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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RAB5AP20339 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB5AP20339 AL356387.1-201ENST00000426321 476 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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RAB5AP20339 BACH1-IT2-201ENST00000436529 806 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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RAB5AP20339 LINC01989-201ENST00000566930 1081 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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RAB5AP20339 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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RAB5AP20339 FAM111B-201ENST00000343597 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB5AP20339 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB5AP20339 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB5AP20339 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB5AP20339 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB5AP20339 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB5AP20339 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB5AP20339 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB5AP20339 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB5AP20339 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB5AP20339 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB5AP20339 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB5AP20339 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB5AP20339 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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