Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 NXF2B-205ENST00000618881 3193 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 NPPA-AS1-201ENST00000400892 936 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 FTH1P26-201ENST00000406512 701 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 RN7SKP39-201ENST00000410773 322 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 AL662791.3-201ENST00000413771 776 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 SPRY4-AS1-201ENST00000414314 521 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 GRPEL2P2-201ENST00000421856 670 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 TBX18-AS1-201ENST00000423086 421 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 LINC01221-201ENST00000432488 662 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 LINC01638-202ENST00000444114 637 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 LINC01961-201ENST00000449954 745 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 AL356364.1-201ENST00000458443 182 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 AC079193.1-201ENST00000460497 588 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 PGAP2-210ENST00000464441 699 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 RN7SL456P-201ENST00000469290 295 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 AC025271.1-201ENST00000485045 429 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 RN7SL776P-201ENST00000493390 268 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 AC021146.11-201ENST00000503319 491 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 AC107952.1-201ENST00000524200 376 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 AL109628.1-201ENST00000556877 366 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 AL136084.2-214ENST00000587726 716 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 OR7A11P-201ENST00000597719 953 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 AC024085.1-201ENST00000604299 432 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 AL121782.1-201ENST00000611242 413 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 AC005393.1-201ENST00000617916 584 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 TPT1-AS1-221ENST00000618947 520 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 GOT2P1-201ENST00000440922 1309 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 Z93022.1-201ENST00000433228 1554 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 ZFY-207ENST00000625061 2273 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 DEFB4A-201ENST00000302247 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 OR52D1-201ENST00000322641 1065 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 SPRR2D-202ENST00000368756 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 RN7SKP137-201ENST00000411074 307 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 KCND3-AS1-201ENST00000419258 383 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 AC106870.2-201ENST00000421411 691 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 AL022157.1-201ENST00000439622 665 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 AC027124.1-201ENST00000440852 466 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 AL353803.3-201ENST00000444641 335 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 AP001469.2-201ENST00000444966 390 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 ZNF197-AS1-201ENST00000447691 623 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 ST13P21-201ENST00000453250 1098 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 RPL5P15-201ENST00000475870 897 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 AC106760.2-201ENST00000504159 619 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 LINC01098-201ENST00000507870 1034 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 CASC11-203ENST00000519071 791 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 LINC02055-203ENST00000520068 712 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 AC079385.3-201ENST00000552415 809 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 AL132640.1-201ENST00000559594 619 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IMPG1Q17R60 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms