Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AF274855.1-201ENST00000411474 850 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 E2F6P1-201ENST00000428850 745 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 E2F6P3-201ENST00000441743 743 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AL392046.1-201ENST00000450742 569 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 TFP1-203ENST00000490470 561 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC094105.1-201ENST00000509745 560 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AP003438.1-201ENST00000518704 435 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC023906.3-201ENST00000559825 874 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 PIRT-201ENST00000580256 3810 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 MBD5-221ENST00000637159 902 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AL513283.1-203ENST00000640010 891 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC011753.2-201ENST00000425576 610 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC106874.1-201ENST00000440495 646 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC133965.1-201ENST00000452984 354 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC147651.1-201ENST00000453149 572 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 LINC01098-201ENST00000507870 1034 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC007991.4-201ENST00000522970 605 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AL049829.2-201ENST00000554010 285 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC068408.1-201ENST00000577406 1144 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 LINC00906-202ENST00000587998 648 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 RPS27L-208ENST00000635699 693 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 TMBIM6-202ENST00000395006 2598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms