Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 C8orf34-AS1-201ENST00000512294 1600 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 RPSAP60-201ENST00000415403 880 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 AC245047.1-201ENST00000433276 873 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 AL035420.1-202ENST00000450129 357 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 MEF2AP1-201ENST00000454867 863 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 RN7SL143P-201ENST00000496780 297 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 AC112225.1-201ENST00000508230 297 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 DIMT1P1-201ENST00000603970 763 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 EDRF1-AS1-214ENST00000622798 526 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 NARS2-204ENST00000528850 2137 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 PPP2R5C-205ENST00000445439 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 ARPP21-220ENST00000441454 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 RGS5-215ENST00000439699 1441 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 PDE11A-203ENST00000409504 2102 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 CALB1-208ENST00000518457 1490 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
CCDC96Q2M329 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 RPS7-201ENST00000304921 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 RGS5-202ENST00000367903 934 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 HNRNPH1P2-201ENST00000396845 1210 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 SPATA20P1-201ENST00000423089 438 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 MORF4L1P5-201ENST00000433352 961 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 DEFA11P-201ENST00000446470 261 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 QTRT2-209ENST00000479882 1196 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AGK-205ENST00000492693 1046 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AC010634.1-201ENST00000513925 540 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AC092376.1-201ENST00000569677 335 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 CCL2-202ENST00000580907 736 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 HOXA11-AS1_3.1-201ENST00000613383 98 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 ZHX3-217ENST00000560361 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AP002001.1-202ENST00000525797 1754 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 MEPE-204ENST00000497649 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 LINC00907-205ENST00000589068 1812 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms