Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 TATDN2P3-201ENST00000452855 3665 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 IAPP-205ENST00000542023 2015 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 OCM2-201ENST00000257627 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 EIF4A1P2-201ENST00000422633 1220 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 RPS19P6-201ENST00000441327 433 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 LINC00349-201ENST00000448748 841 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC022080.2-201ENST00000452932 533 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 BBOF1-202ENST00000463558 550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC108159.1-201ENST00000505408 489 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 RNA5SP96-201ENST00000516041 107 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 IGLVVII-41-1-201ENST00000518405 151 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC090527.1-201ENST00000557965 431 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC026770.1-201ENST00000558994 581 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC126323.5-201ENST00000569913 592 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC090283.1-201ENST00000582101 265 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AL589182.1-201ENST00000611785 320 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC007671.1-201ENST00000616957 830 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC092683.1-202ENST00000620023 754 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC159540.2-201ENST00000621110 754 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 SPTY2D1-AS1-206ENST00000636011 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 GTF2H3-201ENST00000228955 1472 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 DTHD1-206ENST00000639862 3819 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 LCP2-206ENST00000521416 1599 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 LINC01205-201ENST00000489670 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 MS4A12-201ENST00000016913 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
ACADSBP45954 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms