Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AC138915.4-201ENST00000565549 4147 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 ZNF549-204ENST00000602149 5505 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 STAMBPL1-201ENST00000371922 1899 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 ZNF770-201ENST00000356321 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 OLFM5P-201ENST00000411807 1478 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC067942.1-201ENST00000488045 1493 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 ZNF611-202ENST00000453741 4380 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 HAVCR1-205ENST00000523175 1449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 LINC01677-204ENST00000635342 1329 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 IL37-202ENST00000311328 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 TAC1-203ENST00000350485 975 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 IL37-205ENST00000353225 652 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 DYNLRB1-202ENST00000357156 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 RGS8-202ENST00000367556 843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 SP140-202ENST00000373645 814 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 CSNK2B-202ENST00000375866 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 CBWD5-205ENST00000377395 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 CREM-214ENST00000395887 849 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 RPL24P7-201ENST00000399435 453 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 OR7E91P-201ENST00000400027 866 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 NPPA-AS1-201ENST00000400892 936 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 PPIAP25-201ENST00000420177 540 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC064875.1-203ENST00000422996 582 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 IYD-207ENST00000425615 684 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 MRLN-202ENST00000430431 495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 BX119917.1-201ENST00000432517 502 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 LINC00460-201ENST00000435024 631 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 LINC00350-201ENST00000438640 422 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 MIR4435-2HG-211ENST00000443467 826 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 SAP18P3-201ENST00000449663 396 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL590490.1-201ENST00000455599 316 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC080129.1-201ENST00000457815 406 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 CREM-224ENST00000468236 582 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC087385.2-201ENST00000477729 498 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 RN7SL332P-201ENST00000482163 254 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 CREM-234ENST00000484283 660 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC107029.1-201ENST00000484675 465 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 CREM-236ENST00000487763 429 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 RN7SL434P-201ENST00000495872 271 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC008417.1-201ENST00000510014 565 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC017007.5-201ENST00000511590 874 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC006499.1-201ENST00000511870 850 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC093281.1-201ENST00000514239 549 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 NTAN1P2-201ENST00000515730 940 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 ERLIN2-210ENST00000523107 771 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC123767.1-204ENST00000523523 273 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC023595.1-201ENST00000536216 564 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC073611.1-201ENST00000550263 647 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AP005202.2-201ENST00000582386 658 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 RN7SL192P-201ENST00000584303 299 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC060766.6-201ENST00000589099 394 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC073911.1-201ENST00000592296 504 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC019322.2-201ENST00000605634 147 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC122710.3-201ENST00000606566 541 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 HNF4A-AS1-202ENST00000609152 413 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms