Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC105150.1-201ENST00000518011 551 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC091982.1-201ENST00000518134 520 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 IGHVII-51-2-201ENST00000519778 259 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 BRF2-203ENST00000521170 550 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC105206.2-201ENST00000523556 515 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 CD59-208ENST00000527577 686 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AP002360.1-204ENST00000529331 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC084361.1-201ENST00000537730 607 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 UBC-213ENST00000546120 718 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AL162311.2-201ENST00000550416 709 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 WDR20-210ENST00000556511 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC087516.2-203ENST00000558875 601 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC015909.4-201ENST00000577175 578 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 MIR4519-201ENST00000579767 58 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AL138966.1-201ENST00000603212 313 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC245100.4-207ENST00000640776 1082 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC024257.3-201ENST00000595310 3645 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 GOT1-201ENST00000370508 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 PGA3-201ENST00000325558 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 VNN3-202ENST00000367927 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 SCLT1-201ENST00000281142 3055 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 ARPP21-203ENST00000396482 2416 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 INSC-202ENST00000379556 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 GPR156-203ENST00000464295 4442 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 CDH23-213ENST00000619887 4224 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 YIPF5-201ENST00000274496 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 CMTR1-201ENST00000373451 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 TMBIM1-214ENST00000444881 2936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 PIPSL-201ENST00000480546 3350 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 SPOCK3-207ENST00000504953 2900 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 GUCY1A2-203ENST00000526355 16205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC008124.1-201ENST00000609803 9730 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 ACAD10-203ENST00000455480 4071 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 ZC3H14-211ENST00000555755 2529 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 CREB3L2-207ENST00000616381 7133 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 SLC18A1-204ENST00000437980 2822 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 GPATCH2L-209ENST00000556663 2112 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 CDHR2-203ENST00000506348 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 STRAP-201ENST00000025399 1442 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 USP17L10-202ENST00000421288 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 DENND1B-201ENST00000235453 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 ALDH2-201ENST00000261733 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 NXF5-207ENST00000537026 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 MYO1E-201ENST00000288235 8673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 CD36-214ENST00000447544 2298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 ITGBL1-201ENST00000376162 2007 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 PTGES3L-AARSD1-203ENST00000409399 2042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 RBM4-206ENST00000483858 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 ZNF304-202ENST00000391705 4313 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 KRTAP8-1-201ENST00000329621 556 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 SNORA70.1-201ENST00000363367 141 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 LINC01643-201ENST00000412218 757 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AL161740.1-201ENST00000417420 610 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 SWI5-203ENST00000418976 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 MT1XP1-201ENST00000421314 186 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC073188.2-201ENST00000424036 701 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC006455.1-201ENST00000426550 517 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AL512590.1-201ENST00000430691 821 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 LINC00475-207ENST00000438322 424 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 RN7SL546P-201ENST00000479428 290 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 LINC02065-201ENST00000509924 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC233964.1-201ENST00000512165 1089 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 PTPN20-226ENST00000513156 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 PTPN20-228ENST00000513266 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC022778.1-201ENST00000518302 545 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AP003550.1-201ENST00000522416 414 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 IGLV2-5-201ENST00000522922 277 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AP000442.2-201ENST00000531108 440 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 KHNYN-203ENST00000554268 760 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AL354861.2-202ENST00000580326 483 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 MIR3131-201ENST00000583592 63 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC006504.5-209ENST00000591549 500 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 HIST1H2BB-201ENST00000615966 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC068631.1-207ENST00000630315 821 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 GON4L-202ENST00000361040 5118 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC113554.2-201ENST00000577647 4862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.1 ms