Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 LINC00518-202ENST00000479822 906 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AC093878.1-201ENST00000515630 432 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AC026770.1-201ENST00000558994 581 ntTSL 4 BASIC9.51□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AC007861.1-201ENST00000576671 674 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC9.51□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AC010980.1-204ENST00000589724 585 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 STARD13-AS-240ENST00000609608 865 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 LRMDA-216ENST00000611306 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 EAPP-205ENST00000618169 1237 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
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USP35Q9P2H5 ADGRL3-209ENST00000508693 5009 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AC007278.1-201ENST00000450893 1327 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.51□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 ZNF385B-202ENST00000409343 2750 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
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USP35Q9P2H5 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 GPCPD1-201ENST00000379019 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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USP35Q9P2H5 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
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USP35Q9P2H5 CAST-228ENST00000509903 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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USP35Q9P2H5 SLFN12L-201ENST00000260908 3119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 ZNF699-201ENST00000308650 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 NRXN1-206ENST00000402717 2508 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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USP35Q9P2H5 AL671511.1-201ENST00000425033 3458 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 LINC02073-201ENST00000588341 2845 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 ARHGAP12-204ENST00000375250 4914 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 DDX42-203ENST00000457800 3323 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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