Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 OR2L13-203ENST00000641893 1817 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 ZNF761-202ENST00000432094 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AC125232.1-201ENST00000452554 1408 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 SNX25-207ENST00000618785 3151 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 NXF2B-205ENST00000618881 3193 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AC007731.1-202ENST00000610338 1870 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 GNG3-201ENST00000294117 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 HNRNPCL4-201ENST00000323770 882 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 HHLA3-203ENST00000370940 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AC226101.1-201ENST00000401483 387 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 RPSAP44-201ENST00000406712 884 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 RN7SKP148-201ENST00000410179 275 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 RN7SKP39-201ENST00000410773 322 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 SNX18P13-201ENST00000412442 529 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AC096537.2-201ENST00000413707 714 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 CYP4F34P-201ENST00000425951 481 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 SDHC-204ENST00000432287 460 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 NIP7P1-201ENST00000433227 512 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AC092801.1-201ENST00000443763 581 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AC108463.2-201ENST00000451230 412 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AL928654.1-201ENST00000476081 354 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 NACAP6-201ENST00000509572 622 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 RPS20-202ENST00000518875 671 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 LINC01603-202ENST00000519557 712 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 OXR1-212ENST00000521592 993 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AC023078.5-201ENST00000528646 707 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AP000662.1-201ENST00000530952 487 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 OR7E161P-201ENST00000533722 967 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 PSMA6-204ENST00000553809 879 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 IDH3A-223ENST00000561366 389 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AC009303.2-206ENST00000588042 786 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 SIGLECL1-205ENST00000597824 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 BX005040.2-201ENST00000620504 370 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 GOSR2-222ENST00000639031 885 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AC015969.1-201ENST00000366218 1416 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 LINC01990-201ENST00000609293 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 MEPE-201ENST00000361056 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 RN7SKP55-201ENST00000364888 307 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms