Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 UTY-213ENST00000612274 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 LNPK-201ENST00000272748 7610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC006116.1-201ENST00000587908 2171 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 OR2L13-203ENST00000641893 1817 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 TMEM246-203ENST00000374851 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 KLHL5-204ENST00000504108 2690 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC016930.1-201ENST00000468766 2205 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 SPATA31A7-206ENST00000619167 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 GALK2-201ENST00000327171 5299 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 MLLT3-203ENST00000380338 6772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 CASP10-206ENST00000374650 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 USP32P1-203ENST00000417524 1014 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 HNRNPA1P30-201ENST00000424329 751 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 UQCRHP1-204ENST00000424609 274 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC092164.1-203ENST00000444501 723 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AL772337.3-201ENST00000447524 452 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 RPS26P11-201ENST00000463445 348 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 RPL23P10-201ENST00000468780 412 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 RPS26P6-201ENST00000475156 348 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC139713.2-212ENST00000506982 832 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC087273.2-201ENST00000519038 634 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC079866.1-201ENST00000534985 1220 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC011603.2-202ENST00000552893 504 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 PEX11A-205ENST00000561257 978 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 OR4C49P-201ENST00000563891 900 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC005837.2-201ENST00000587459 479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AL365259.1-201ENST00000606334 509 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AL359094.1-211ENST00000608350 335 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 ZMYND8-216ENST00000471951 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 LINC00310-204ENST00000430922 2086 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 TENM4-201ENST00000278550 14000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 TMC5-208ENST00000564959 2434 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 OSBPL1A-202ENST00000357041 1869 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 BICC1-202ENST00000373886 5475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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HOXD12P35452 KYNU-203ENST00000409512 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC132219.2-201ENST00000624416 2327 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 BANF2-201ENST00000246090 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 RNA5SP472-201ENST00000363868 119 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AP000812.1-201ENST00000378140 477 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 RAC1P4-201ENST00000419413 579 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AL022100.1-202ENST00000421214 548 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 CASC6-201ENST00000437768 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 PSPC1P2-201ENST00000455130 225 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 NSRP1-205ENST00000479218 540 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 SMIM20-202ENST00000514384 774 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC093878.1-201ENST00000515630 432 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 RPL10P18-201ENST00000519384 309 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
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