Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
YBX2Q9Y2T7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
YBX2Q9Y2T7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
YBX2Q9Y2T7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
YBX2Q9Y2T7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
YBX2Q9Y2T7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
YBX2Q9Y2T7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
YBX2Q9Y2T7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
YBX2Q9Y2T7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
YBX2Q9Y2T7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
YBX2Q9Y2T7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
YBX2Q9Y2T7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
YBX2Q9Y2T7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
YBX2Q9Y2T7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
YBX2Q9Y2T7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
YBX2Q9Y2T7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
YBX2Q9Y2T7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
YBX2Q9Y2T7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
YBX2Q9Y2T7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
YBX2Q9Y2T7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
YBX2Q9Y2T7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
YBX2Q9Y2T7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
YBX2Q9Y2T7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
YBX2Q9Y2T7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
YBX2Q9Y2T7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
YBX2Q9Y2T7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
YBX2Q9Y2T7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
YBX2Q9Y2T7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
YBX2Q9Y2T7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
YBX2Q9Y2T7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
YBX2Q9Y2T7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms