Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NUDCQ9Y266 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NUDCQ9Y266 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUDCQ9Y266 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUDCQ9Y266 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUDCQ9Y266 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUDCQ9Y266 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUDCQ9Y266 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUDCQ9Y266 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUDCQ9Y266 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUDCQ9Y266 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NUDCQ9Y266 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUDCQ9Y266 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NUDCQ9Y266 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms