Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms