Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms