Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2LQ9UL33 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms