Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms