Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms