Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms