Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX3Q9UBR4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX3Q9UBR4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX3Q9UBR4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX3Q9UBR4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX3Q9UBR4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX3Q9UBR4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX3Q9UBR4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX3Q9UBR4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX3Q9UBR4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX3Q9UBR4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX3Q9UBR4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX3Q9UBR4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX3Q9UBR4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX3Q9UBR4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX3Q9UBR4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX3Q9UBR4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX3Q9UBR4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX3Q9UBR4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX3Q9UBR4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX3Q9UBR4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX3Q9UBR4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX3Q9UBR4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX3Q9UBR4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX3Q9UBR4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX3Q9UBR4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX3Q9UBR4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX3Q9UBR4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX3Q9UBR4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX3Q9UBR4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LHX3Q9UBR4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms