Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC40.96■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC40.96■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC40.96■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.96■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC40.94■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC40.94■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC40.94■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC40.94■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC40.93■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC40.93■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC40.92■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC40.92■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC40.92■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC40.9■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC40.89■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC40.89■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC40.89■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC40.89■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.14
CCDC180Q9P1Z9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC40.88■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC40.88■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC40.88■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms