Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV58

RNF19A, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19A, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF19AQ9NV58 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF19AQ9NV58 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms