Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDP1Q9NUW8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
TDP1Q9NUW8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TDP1Q9NUW8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDP1Q9NUW8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TDP1Q9NUW8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDP1Q9NUW8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDP1Q9NUW8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDP1Q9NUW8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDP1Q9NUW8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDP1Q9NUW8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDP1Q9NUW8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDP1Q9NUW8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDP1Q9NUW8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDP1Q9NUW8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDP1Q9NUW8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDP1Q9NUW8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDP1Q9NUW8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDP1Q9NUW8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDP1Q9NUW8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDP1Q9NUW8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDP1Q9NUW8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDP1Q9NUW8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDP1Q9NUW8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDP1Q9NUW8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDP1Q9NUW8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDP1Q9NUW8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDP1Q9NUW8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDP1Q9NUW8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDP1Q9NUW8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDP1Q9NUW8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDP1Q9NUW8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDP1Q9NUW8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDP1Q9NUW8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDP1Q9NUW8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDP1Q9NUW8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDP1Q9NUW8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TDP1Q9NUW8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TDP1Q9NUW8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDP1Q9NUW8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TDP1Q9NUW8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TDP1Q9NUW8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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