Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX3

NDUFA4L2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 4-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA4L2Q9NRX3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms