Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms