Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms