Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC52A2Q9HAB3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC52A2Q9HAB3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms