Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9D4

ZNF408, Zinc finger protein 408, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF408Q9H9D4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF408Q9H9D4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms