Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6S0

YTHDC2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC2Q9H6S0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
YTHDC2Q9H6S0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
YTHDC2Q9H6S0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
YTHDC2Q9H6S0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
YTHDC2Q9H6S0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
YTHDC2Q9H6S0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
YTHDC2Q9H6S0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
YTHDC2Q9H6S0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
YTHDC2Q9H6S0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
YTHDC2Q9H6S0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
YTHDC2Q9H6S0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
YTHDC2Q9H6S0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
YTHDC2Q9H6S0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
YTHDC2Q9H6S0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
YTHDC2Q9H6S0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
YTHDC2Q9H6S0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
YTHDC2Q9H6S0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
YTHDC2Q9H6S0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
YTHDC2Q9H6S0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
YTHDC2Q9H6S0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
YTHDC2Q9H6S0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
YTHDC2Q9H6S0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms