Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NXF3Q9H4D5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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