Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 DUXAP7-201ENST00000431038 689 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 AL121694.1-201ENST00000554253 671 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 MCEE-201ENST00000244217 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 ADAM20P2-201ENST00000515830 1273 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 AC008567.2-201ENST00000589751 656 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF39Q9H2S5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 AP000944.1-201ENST00000533886 564 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 CDC23-201ENST00000394884 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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