Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC113Q9H0I3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms