Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSD3Q9BZ95 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms