Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD2

MRPL9, 39S ribosomal protein L9, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL9Q9BYD2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL9Q9BYD2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MRPL9Q9BYD2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL9Q9BYD2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms