Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CARD11Q9BXL7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CARD11Q9BXL7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CARD11Q9BXL7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CARD11Q9BXL7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms