Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms