Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 266.1 ms