Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF4Q9BUZ4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms