Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms