Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LGMNQ99538 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms