Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms