Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms