Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM227BQ96M60 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms