Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms